Z umetno inteligenco proti raku

Zgodba gre nekako takole. Tri leta nazaj je Jinghui Zhang, vodja oddelka za računalniško biologijo v St. Jude Children’s Research Hospital v ameriškem Memphisu, poskušala prenesti 1547 vzorcev iz vladne podatkovne baze in na njih izvesti nekaj poskusov. A zadeve niso šle nič kaj gladko, saj je prenos trajal – dobro leto in pol. Vsakič, ko je Zhangova in njena skupina menila, da ima celoten komplet podatkov in izvedla statistično analizo, ki naj bi preverila ali je to res, se je namreč izkazalo, da je prišlo do takšne ali drugačne napake pri prenosu in da del podatkov manjka.

Takšne težave so se Zhangovi seveda zdele nesprejemljive, zato se je odločila nekaj narediti. Letos aprila je zato stopila v kontakt z Microsoftom in nastal je St. Jude Cloud, spletna storitev, ki znanstvenim in medicinskim ustanovam omogoča dostop do največje podatkovne baze na svetu, povezane z rakom pri otrocih. Baza vsebuje več kot 5000 genomov pacientov bolnišnice St. Jude, kar je največ podatkov, zbranih na enem mestu.

A imeti podatke je le prvi korak. Drugi je seveda njihova obdelava. V ta namen je Microsoft januarja letos, skupaj z dobrodelno ustanovo Stand Up to Cancer, zagnal 11 milijonov dolarjev vreden projekt Convergence 2.0. Gre za projekt, ki težavo Zhangove naslavlja iz druge plati – znanstveniki imajo veliko podatkov in tudi idejo, kako jih obdelati, nimajo pa dovolj računalniškega znanja, da bi to izvedli. Zato je v okviru projekta nastalo sedem ekip, ki poleg zdravnikov, biologov in podobnih znanstvenikov, vključujejo tudi ugledne strokovnjake s področja umetne inteligence in strojnega učenja podjetij in ustanov, kot so Microsoft, MIT in še katere. In kakšen je cilj teh skupin? Recimo to, kar je na svojem področju uspelo narediti podjetju Paige.AI, ki je v povezavi s centrom za raziskave raka Memorial Sloan Kettering iz New Yorka izdelalo algoritem za strojno učenje, s pomočjo katerega analizirajo velikansko bazo kar 25 milijonov digitaliziranih posnetkov različnih tumorjev s ciljem zdravnikom omogočiti bolj natančne diagnoze in  bolj objektivne informacije o možnostih zdravljenja in poteku bolezni.

Foto: Peter Barta